Tým Nakladatelství Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích tvoří ředitel nakladatelství Petr A. Bílek, šéfredaktor Ladislav Nagy, k jehož rukám odevzdávají autoři své rukopisy, a interní redaktoři Kateřina Selner, která se orientuje na oblast humanitních věd, především pak na texty literárněvědné a lingvistické, Peter Demeter, který se věnuje zejména textům z oblasti kultury a sociologie, a současně společně s Blankou Marešovou zajišťuje administrativní chod nakladatelství, a Stanislav Mihulka, který se zaměřuje na texty z oblasti přírodních věd. Nakladatelství dále externě spolupracuje s řadou zkušených překladatelů, redaktorů a grafiků.
